- AMQ – Bandar Udara Internasional Pattimura – Ambon
- AHI – Bandar Udara Amahai – Masohi
- NDA – Bandar Udara Bandaneira – Banda
- DOB – Bandar Udara Dobo – Kepulauan Aru
- LUV – Bandar Udara Dumatubun – Langgur
- SQN – Bandar Udara Emalamo – Sanana
- GLX – Bandar Udara Gamarmalamo – Galela
- GEB – Bandar Udara Gebe – Gebe
- KAZ – Bandar Udara Kuabang – Tobelo
- MAL – Bandar Udara Mangole – Mangole
- NAM – Bandar Udara Namlea – Namlea
- NRE – Bandar Udara Namrole – Namrole
- BJK – Bandar Udara Nangasuri – Benjina
- LAH – Bandar Udara Oesman Sadik – Labuha
- SXK – Bandar Udara Olilit – Saumlaki
- OTI – Bandar Udara Pitu – Morotai
- TTE – Bandar Udara Sultan Babullah – Ternate
- TAX – Bandar Udara Taliabu – Taliabu
- WHI – Bandar Udara Wahai -Pulau Seram